评估MES系统对企业生产效率提升的具体效果可以通过以下几个步骤和指标进行：

1. 设定评估指标：首先需要明确评估的目标和指标，这些指标应涵盖生产效率、质量控制、成本控制、交付能力以及数据准确性等方面 。

2. 生产效率提升指标：评估MES系统是否提高了生产效率，可以通过设备利用率提升率、生产周期缩短率等具体指标进行量化分析 。

3. 成本降低评估：通过对比实施MES系统前后的成本数据，评估系统对生产成本的降低效果，包括人力、物料、能源等方面 。

4. 质量提升评估：通过对比实施前后的质量数据，评估MES系统对产品质量的提升效果，如产品合格率、不良品率、返工率等 。

5. 数据收集与分析：建立起数据采集机制，确保数据的准确性，并利用MES系统的数据分析功能对生产过程进行监控和分析，发现问题和瓶颈 。

6. 用户满意度调查：通过问卷或面谈了解用户对MES系统的使用体验和满意度，包括系统的易用性、功能满足度、对工作效率的提升等 。

7. 系统稳定性与性能分析：评估MES系统的稳定性，包括系统停机时间、性能瓶颈、异常处理能力以及软件更新与维护的效果 。

8. 数据准确性与完整性：确保MES系统数据录入的正确性、数据同步和传输的准确性、数据清洗与校验的质量以及数据报告的准确性 。

9. 综合评估：最后，企业应综合考虑MES系统的绩效和投资回报率（ROI），制定合理的实施策略和投资规划，很大程度地提高MES系统的价值和回报率 。

通过这些方法，企业可以全面了解MES系统的运行效果，发现问题和改进空间，进一步提升企业的生产管理水平和竞争力。