确保云MES系统的数据备份与恢复机制在实际操作中的高效性和可靠性，可以采取以下措施：

1. 定期备份数据：包括全量备份和增量备份，确保备份数据的完整性。全量备份是对整个系统数据进行完整备份，而增量备份则是对自上次备份以来的数据变化部分进行备份。

2. 结合本地和远程备份：采用本地备份和远程备份相结合的方式，提高数据安全性。本地备份便于快速恢复，而远程备份能在本地备份不可用时提供备用方案。

3. 进行数据恢复测试：通过模拟数据恢复过程，验证备份数据的有效性和恢复速度，确保在实际需要时能够顺利恢复数据。

4. 选择可靠的备份工具和服务提供商：确保备份工具和服务的稳定性和可靠性，以防止数据丢失或损坏。

5. 加密和访问控制：对备份数据进行加密，并采取严格的访问控制措施，防止未经授权的数据泄露。

6. 使用云技术：利用云服务进行数据备份，可以提供灵活的存储解决方案，并支持自动化备份流程。

7. 确保备份数据的一致性与完整性：通过校验算法、数据加密等手段来提高备份数据的可靠性。

8. 建立灾难恢复机制：制定应急预案，进行定期的灾难恢复演练，确保在发生灾难时能够快速有效地恢复系统。

9. 定期评估与优化备份策略：随着业务需求的变化，定期评估备份策略的有效性，并根据实际情况进行优化。

10. 监控备份状态：实时监控备份任务的状态，及时处理可能出现的错误或异常情况。

通过上述措施，企业可以确保云MES系统的数据备份与恢复机制在实际操作中的高效性和可靠性。