在技术标准不统一的情况下，企业选择合适的MES和ERP系统进行集成可以遵循以下步骤和策略：

1. 明确需求分析：首先，企业需要深入理解并明确ERP与MES集成的具体目标与需求，制定详细的业务流程图，确保对接方案贴合实际业务需求 。

2. 选择支持开放标准的系统：选用具备良好扩展性和兼容性的ERP和MES系统，支持标准接口协议，降低集成成本 。

3. 引入集成平台或中间件：利用成熟的集成平台或中间件技术，可以简化接口开发，提高集成效率，并有助于未来系统升级时保持良好的兼容性 。

4. 强化跨部门沟通与合作：通过项目团队建设，加强各部门之间的沟通交流，确保各方对集成目标达成共识，并共同推进项目的落地实施 。

5. 持续优化与迭代：集成不是一次性任务，而是需要在实践中不断优化和完善的过程。企业应建立完善的运维体系，对集成后的效果进行定期评估和改进 。

6. 考虑系统的可扩展性和灵活性：选择那些已经与主流ERP系统有成功集成案例的MES供应商，以降低集成风险和成本 。

7. 技术架构和数据模型的匹配：了解两个系统的技术架构和数据模型，确保它们之间能够顺畅地进行数据交换 。

8. 评估供应商的技术支持和服务能力：充分与供应商沟通，了解其技术支持和服务能力，确保在系统部署和后期维护过程中能够得到及时、有效的支持 。

通过这些策略，企业可以在技术标准不统一的情况下，有效地选择合适的MES和ERP系统进行集成，实现生产和管理的无缝对接，提升整体运营效率。